Das Museum in der im 13. Jahrhundert erbauten Nikolaikirche ist eines der wenigen Museen, das sich in einem Sakralbau befindet. Genießen Sie die Kirchenkunst in ihrem historischen Kontext: Hier befinden sich mittelalterliche Grabsteine, einzigartige Altäre und das berühmteste Kunstwerk in Tallinn: ein Fragment des Gemäldes "Totentanz" von Bernt Notke. Das mehr als 500 Jahre alte Gemälde vermittelt das Weltbild des mittelalterlichen Menschen, ist aber auch heutzutage aktuell. Vom besonderen Wert ist die in der Silberkammer exponierte Sammlung der aus Silber hergestellten Gegenstände der Gilden und Zünfte sowie der Schwarzhäupterbruderschaft.

Ein gläserner Aufzug und eine Himmelsetage führen zum Kirchturm, der einen 360°-Blick auf die Altstadt bietet.